Cet article analyse les transformations contemporaines de la production de connaissances et d’expertise en santé au travail en replaçant ces évolutions avec les spécificités et les évolutions récentes de ce secteur d’intervention publique. Après avoir montré comment les changements des politiques de santé publique contraignent à un certain nombre de transformations dans le domaine de la santé au travail, notamment en obligeant à créer de nouvelles instances d’expertises, cet article analyse comment l’expertise des risques professionnels s’institutionnalise et les effets induits sur les modalités de la prise de décision dans ce domaine. Il montre qu’au-delà de bouleversements importants, les rapports de pouvoir qui caractérisent ce domaine d’intervention restent relativement stables. Au delà du cas de la santé au travail, cet article invite à reposer les questions de la production de connaissances et de l’expertise en les mettant en perspective avec les rapports de force qui structurent un secteur d’intervention publique.